W administracji państwowej Jerzy Miller pracuje od 1990 r. Jest bezpartyjny. Ma opinię fachowca w sprawach finansów i administracji, człowieka dialogu, który w sytuacjach kryzysowych potrafi podejmować zrównoważone decyzje. W listopadzie 2007 r. z rekomendacji PO został wojewodą małopolskim.
Miller, urodzony w 1952 r. w Krakowie, jest absolwentem Akademii Górniczo-Hutniczej. Studiował na Wydziale Elektrotechniki, Elektroniki i Informatyki - ze specjalnością automatyka cyfrowa. Karierę zawodową zaczynał jako pracownik naukowy w Instytucie Obróbki Skrawaniem. W latach 1990-91 był dyrektorem wydziału organizacji i nadzoru Urzędu Wojewódzkiego w Krakowie, dyrektorem tego urzędu, a później wicewojewodą krakowskim (1993-98).
Od lutego 1998 do 2000 r. był wiceministrem finansów w rządzie Jerzego Buzka. W latach 2001-2003 Miller był doradcą prezesa Narodowego Banku Polskiego. Później przez trzy miesiące kierował Agencją Restrukturyzacji i Modernizacji Rolnictwa. W 2003 r. został dyrektorem Departamentu Komunikacji Społecznej NBP i członkiem Zarządu NBP. Od września 2004 do września 2006 był prezesem Narodowego Funduszu Zdrowia. Od grudnia 2006 był wiceprezydentem Warszawy.
W maju 2006 r. rada NFZ nie poparła wniosku o odwołanie Millera, który złożył ówczesny minister zdrowia prof. Zbigniew Religa na prośbę premiera. Miller stracił stanowisko prezesa Funduszu po zmianach w ustawie o świadczeniach opieki zdrowotnej finansowanych ze środków publicznych. Radzie NFZ odebrano uprawnienia do powoływania i odwoływania prezesa i przyznano je premierowi.
>>>Wszystko, co chcielibyście wiedzieć o aferze hazardowej
Jak podkreślają lekarze zrzeszeni w Porozumieniu Zielonogórskim, prezesura Millera należała do najspokojniejszych od czasu utworzenia NFZ. Choć krytykowany za niektóre decyzje, zwłaszcza związane z katalogiem i wyceną procedur medycznych, z reguły był dobrze oceniany z punktu widzenia finansów Funduszu.
Prof. Religa podkreślał, że Miller jest "mistrzem od prowadzenia spraw finansowych i wyprowadził NFZ na prostą". Religa jako minister zdrowia deklarował wielokrotnie, że nie widzi podstaw do zmiany na stanowisku prezesa NFZ. B. wiceminister zdrowia Bolesław Piecha (PiS) krytykował Millera m.in. za programy lekowe.
W latach 2000-2002 Miller był doradcą prezydenta Gruzji Eduarda Szewardnadze. W ramach dwuletniego projektu doradztwa makroekonomicznego dla Gruzji, finansowanego przez Amerykanów, eksperci pod kierunkiem Leszka Balcerowicza, a potem Jerzego Millera współpracowali z prezydentem i rządem Gruzji w przygotowaniu reform dla tego kraju.
Od listopada 2007 Miller był wojewodą małopolskim; podczas jego urzędowania w Małopolsce uruchomiono pilotażowy w skali kraju program koordynacji pracy służb ratowniczych w ramach Centrum Powiadamiania Ratunkowego. Jako pierwsi w kraju pracownicy krakowskiego CPR mają możliwość automatycznej lokalizacji telefonów stacjonarnych i komórkowych, z których dzwonią zgłaszający.
Miller zainicjował też tworzenie internetowej bazy grobów wojennych na terenie Małopolski. Można w niej zobaczyć opatrzone fotografiami opisy miejsc pochówków ofiar działań wojennych od czasów najazdu szwedzkiego po okres stalinowski, poznać liczbę poległych, ich narodowość, personalia oraz daty śmierci, a tam gdzie było to możliwe do ustalenia - także przynależność do formacji bojowych i stopnie wojskowe. Z pomysłu tego mają korzystać także inne województwa.
Od 2008 r. funkcjonuje uruchomiony przez Millera program opieki krótkoterminowej nad osobami chorymi, starszymi i niepełnosprawnymi, które na stałe pozostają pod opieką własnych rodzin. Chorzy przez dwa tygodnie mogą bezpłatnie przebywać w ośrodkach, w których mają zapewnioną opiekę i rehabilitację, a ich stali opiekunowie mogą w tym czasie odpocząć. Program jest finansowany z budżetu wojewody małopolskiego ze środków przeznaczonych na pomoc społeczną.